RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611117.1

TTC28-AS1_2.1-201, humanhuman

BASIC

Gene TTC28-AS1_2, Length 157 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MSCO60682 206 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RHOBTB3O94955 611 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PDE6AP16499 860 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FBLP22087 321 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTGS2P35354 604 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADCY8P40145 1251 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TBR1Q16650 682 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BTBD8Q5XKL5 378 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PCSK4Q6UW60 755 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LBX2Q6XYB7 198 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ANKRD35Q8N283 1001 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SHCBP1Q8NEM2 672 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DCAF4Q8WV16 495 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TMEM176AQ96HP8 235 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MPHOSPH9Q99550 1183 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IER2Q9BTL4 223 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EPN3Q9H201 632 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR10A2Q9H208 303 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RIC8BQ9NVN3 520 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FAM184BQ9ULE4 1060 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TELO2Q9Y4R8 837 aa3□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 B2RBV5 119 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ACOT7O00154 380 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC26A4O43511 780 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RPS6KA4O75676 772 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SOD2P04179 222 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KRT4P19013 534 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IL12RB1P42701 662 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRE11P49959 708 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PPP2R2AP63151 447 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PCOLCEQ15113 449 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FXNQ16595 210 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DPH6Q7L8W6 267 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 EEPD1Q7L9B9 569 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IFNL3Q8IZI9 196 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NLGN4XQ8N0W4 816 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 OR14K1Q8NGZ2 314 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CFHR4Q92496 578 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ALG1Q9BT22 464 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CD244Q9BZW8 370 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 INCENPQ9NQS7 918 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTGFRNQ9P2B2 879 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa2.99□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PMS2P1A4D2B8 440 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GCP02774 474 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTGS1P23219 599 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GPR85P60893 370 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 IL13RA1P78552 427 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LRCH2Q5VUJ6 765 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GPR135Q8IZ08 494 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 HAS1Q92839 578 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RIOX1Q9H6W3 641 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GALNT8Q9NY28 637 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa2.98□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A0G2JNJ9 132 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 A0A1W2PRX2 142 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 DLX3O60479 287 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GJA4P35212 333 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADRA1BP35368 520 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 GRIA2P42262 883 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 NT5DC4Q86YG4 428 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SYNE4Q8N205 404 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MIEF2Q96C03 454 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 BTBD2Q9BX70 525 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 Q9UFV3 132 aa2.97□□□□□ -1.93
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 PRAMEF25A6NGN4 478 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MASP2O00187 686 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRAF5O00463 557 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 LMNAP02545 664 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MAN2A2P49641 1150 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 COL10A1Q03692 680 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 RIN1Q13671 783 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SLC10A6Q3KNW5 377 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 TRIM68Q6AZZ1 485 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 SYCE2Q6PIF2 218 aa2.96□□□□□ -1.94
TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 KCNT2Q6UVM3 1135 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms