RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa12.95□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYCT1Q8N699 235 aa12.95□□□□□ -0.34
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa12.95□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPAG5Q96R06 1193 aa12.95□□□□□ -0.34
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ASIC2Q16515 512 aa12.95□□□□□ -0.34
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TUBBP07437 444 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPS2Q13227 327 aa12.94□□□□□ -0.34
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLS1Q14651 629 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FRMD5Q7Z6J6 570 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OGFOD1Q8N543 542 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AIPL1Q9NZN9 384 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNTNAP1P78357 1384 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CALUO43852 315 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM13AO94988 1023 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM193AP78312 1265 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MCTP2Q6DN12 878 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf186Q6ZWK4 172 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC35C1Q96A29 364 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AGBL1Q96MI9 1066 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SH2D3AQ9BRG2 576 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GOPCQ9HD26 462 aa12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TCP1P17987 556 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NAB2Q15742 525 aa12.93□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC15A2Q16348 729 aa12.93□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CEP55Q53EZ4 464 aa12.93□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BANK1Q8NDB2 785 aa12.93□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM151AQ8WW52 585 aa12.93□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SELENOOQ9BVL4 669 aa12.93□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCS1LQ9Y276 419 aa12.93□□□□□ -0.34
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHTN1A0MZ66 631 aa12.93□□□□□ -0.34
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