RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596951.5

FCHO1-218, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-218ENST00000596951 STYK1Q6J9G0 422 aa12.64□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 BAP1Q92560 729 aa12.64□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 SGSM3Q96HU1 749 aa12.64□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 NDST4Q9H3R1 872 aa12.64□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12.64□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 E9PMD0 336 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 TRAPPC3O43617 180 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 MYL1P05976 194 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 E2F5Q15329 346 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 VWA3BQ502W6 1294 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 ADGRF4Q8IZF3 695 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 FAXDC2Q96IV6 333 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 MTMR9Q96QG7 549 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 PLCB1Q9NQ66 1216 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 RNF14Q9UBS8 474 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 H0YGN5 161 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 PALMO75781 387 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 HSD17B3P37058 310 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 SCTRP47872 440 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 GALNT17Q6IS24 598 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 CNNM4Q6P4Q7 775 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 CNKSR1Q969H4 720 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 SEC16BQ96JE7 1060 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 AK8Q96MA6 479 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 JMJD4Q9H9V9 463 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 TSKSQ9UJT2 592 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 NFS1Q9Y697 457 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 TMCO5BA8MYB1 307 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 LAD1O00515 517 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 ATP2C2O75185 946 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 PAX7P23759 505 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 ECHS1P30084 290 aa12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 GOLGA6L10A6NI86 522 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 MYZAPP0CAP1 466 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 ERVK-9P63128 1117 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 HGSNATQ68CP4 663 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 KLHL7Q8IXQ5 586 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 IQCDQ96DY2 449 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF287Q9HBT7 754 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 POTEB3A0JP26 581 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 POTECB2RU33 542 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 MEIS1O00470 390 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 MYBP10242 640 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF844Q08AG5 666 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 CENPPQ6IPU0 288 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 PDXDC1Q6P996 788 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 TLDC1Q6P9B6 456 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 POTEBQ6S5H4 581 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC125Q86Z20 511 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 KIRREL3Q8IZU9 778 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 TTLL6Q8N841 843 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 HAS1Q92839 578 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 LZTS2Q9BRK4 669 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 COA1Q9GZY4 146 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 RIOX1Q9H6W3 641 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 NAV1Q8NEY1 1877 aa12.62□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 FRMD3A2A2Y4 597 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 TRAF5O00463 557 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 AMPD3Q01432 767 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 KRT79Q5XKE5 535 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 LRIG3Q6UXM1 1119 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 KIAA0825Q8IV33 1275 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 MAGEC3Q8TD91 643 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 RAPGEF5Q92565 580 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 RAD54LQ92698 747 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 USP40Q9NVE5 1235 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 GRID2IPA4D2P6 1211 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 C5orf60A6NFR6 353 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 TMEM266Q2M3C6 531 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 UNC13DQ70J99 1090 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 C3orf20Q8ND61 904 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 SLC16A10Q8TF71 515 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 KIAA1024Q9UPX6 916 aa12.61□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 DCDC2CA8MYV0 355 aa12.6□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 EZRP15311 586 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 KLRC1P26715 233 aa12.6□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 EHHADHQ08426 723 aa12.6□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 COASYQ13057 564 aa12.6□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 SEMA3FQ13275 785 aa12.6□□□□□ -0.39
FCHO1-218ENST00000596951 XRCC4Q13426 336 aa12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms