RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 NDST4Q9H3R1 872 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SEMA6BQ9H3T3 888 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 DEF6Q9H4E7 631 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PANK4Q9NVE7 773 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF446Q9NWS9 450 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 FHOD1Q9Y613 1164 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SOBPA7XYQ1 873 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TACC1O75410 805 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC16A2P36021 539 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 EPS15P42566 896 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 EHHADHQ08426 723 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 Q4G0T1 1027 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MIIPQ5JXC2 388 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 DACT2Q5SW24 774 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TTBK2Q6IQ55 1244 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TATDN1Q6P1N9 297 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 DYMQ7RTS9 669 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 GPBP1Q86WP2 473 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXO11Q86XK2 927 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CLEC10AQ8IUN9 316 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM58Q8NG06 486 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 RUBCNQ92622 972 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM20AQ96MK3 541 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PARD6BQ9BYG5 372 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TANGO6Q9C0B7 1094 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNMB3Q9NPA1 279 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 GUCA1BQ9UMX6 200 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 NR3C2P08235 984 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G4BP0C869 781 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 HERVK_113P62684 666 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP4P98171 946 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 AMPD2Q01433 879 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 NFIAQ12857 509 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 EDRF1Q3B7T1 1238 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRC55Q6ZSA7 311 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 HDXQ7Z353 690 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA0825Q8IV33 1275 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC155Q8N6L0 562 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CAGE1Q8TC20 777 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 HAS1Q92839 578 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CHP1Q99653 195 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SH2D4AQ9H788 454 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 DBNDD1Q9H9R9 158 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP72Q9P209 647 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB21Q9UL25 225 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SAR1BQ9Y6B6 198 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SIPA1L1O43166 1804 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 AKR1B10O60218 316 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 TBCAO75347 108 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 BMP3P12645 472 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SREBF1P36956 1147 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MARSP56192 900 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ZCWPW2Q504Y3 356 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR59Q6PJI9 974 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MXD3Q9BW11 206 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJC18Q9H819 358 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 MMRN2Q9H8L6 949 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 PLAGL2Q9UPG8 496 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SIK3Q9Y2K2 1263 aa10.15□□□□□ -0.78
EFTUD2-222ENST00000592408 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-222ENST00000592408 FRMD3A2A2Y4 597 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3CDO00329 1044 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAF5O00463 557 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-222ENST00000592408 CETN3O15182 167 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-222ENST00000592408 CALUO43852 315 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-222ENST00000592408 LCA5LO95447 670 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D8O95759 1140 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFB10O96000 172 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms