RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ATP9AO75110 1047 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF18P17022 549 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 YWHABP31946 246 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCD1P33897 745 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 STX17P56962 302 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 PSMC6P62333 389 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 STK4Q13043 487 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 DPP9Q86TI2 863 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 DRC1Q96MC2 740 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 EFCC1Q9HA90 598 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 PARVGQ9HBI0 331 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 VTA1Q9NP79 307 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-212ENST00000591041 UBE4BO95155 1302 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 BACH1O14867 736 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ACTR2P61160 394 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 EHHADHQ08426 723 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 TTLL4Q14679 1199 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 REEP2Q9BRK0 252 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MLXIPQ9HAP2 919 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 OLFML3Q9NRN5 406 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PPME1Q9Y570 386 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 RGS20O76081 388 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ALDH1A1P00352 501 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PGK2P07205 417 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ADORA2AP29274 412 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ARSHQ5FYA8 562 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CENPPQ6IPU0 288 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 METTL7BQ6UX53 244 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf186Q6ZWK4 172 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SCFD2Q8WU76 684 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 GNA14O95837 355 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MAPTP10636 758 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 XKR3Q5GH77 459 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP4F22Q6NT55 531 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PADI6Q6TGC4 694 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MYCT1Q8N699 235 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM167AQ96KS9 214 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PORCNQ9H237 461 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 AZI2Q9H6S1 392 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 GABBR1Q9UBS5 961 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC34A2O95436 690 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CCNE2O96020 404 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 TPM1P09493 284 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SCP2P22307 547 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 XKR9Q5GH70 373 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ABHD15Q6UXT9 468 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 GPR142Q7Z601 462 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNL1Q8IU54 200 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF302Q9NR11 478 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 NRBP2Q9NSY0 501 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNJ18B7U540 433 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 AP5Z1O43299 807 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PEX10O60683 326 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MSNP26038 577 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 RARRES1P49788 294 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 IRF5Q13568 498 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 GRB14Q14449 540 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNJ12Q14500 433 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 TTI2Q6NXR4 508 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SPC24Q8NBT2 197 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN18Q99952 460 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 RUSC1Q9BVN2 902 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 H0YCG3 227 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 ATG7O95352 703 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM178BQ8IXR5 827 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP63Q96MT8 703 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 C17orf75Q9HAS0 396 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-212ENST00000591041 GGPS1O95749 300 aa25.01■■□□□ 1.59
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