RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 ENPP3O14638 875 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 HBP1O60381 514 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 CCNE2O96020 404 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 IFNAR1P17181 557 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 NTRK3Q16288 839 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 ATP8B4Q8TF62 1192 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 PHKBQ93100 1093 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 TRPV2Q9Y5S1 764 aa23.47■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 KCNQ1P51787 676 aa23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 RUFY3Q7L099 469 aa23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 TMEM192Q8IY95 271 aa23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 FIBCD1Q8N539 461 aa23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.46■■□□□ 1.35
NFIC-209ENST00000589969 SIP14410 1827 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 COL1A2P08123 1366 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 H3BNC9 293 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ZNF302Q9NR11 478 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa23.45■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.44■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CIITAP33076 1130 aa23.44■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 KRT76Q01546 638 aa23.44■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.44■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.44■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ZBTB10Q96DT7 871 aa23.44■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 NCOR1O75376 2440 aa23.44■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.43■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 RB1P06400 928 aa23.43■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 KLRC1P26715 233 aa23.43■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CD52P31358 61 aa23.43■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 GPM6BQ13491 265 aa23.43■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 TIGD5Q53EQ6 642 aa23.43■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 SWSAP1Q6NVH7 229 aa23.43■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.43■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.42■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 NEFLP07196 543 aa23.42■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 TMEM62Q0P6H9 643 aa23.42■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 PAK2Q13177 524 aa23.42■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 PRR16Q569H4 304 aa23.42■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.42■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 PADI3Q9ULW8 664 aa23.42■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa23.42■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 PSAPP07602 524 aa23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 USP11P51784 963 aa23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CPLX1O14810 134 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ADAMTS3O15072 1205 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 DGKIO75912 1065 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CTNNB1P35222 781 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 BMPR1AP36894 532 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 NLRP5P59047 1200 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ODR4Q5SWX8 454 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 BANK1Q8NDB2 785 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.4■■□□□ 1.34
NFIC-209ENST00000589969 STAG3L1P0CL83 205 aa23.39■■□□□ 1.33
NFIC-209ENST00000589969 NPAS4Q8IUM7 802 aa23.39■■□□□ 1.33
NFIC-209ENST00000589969 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.39■■□□□ 1.33
NFIC-209ENST00000589969 FAM167AQ96KS9 214 aa23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms