RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 VAV2P52735 878 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 GCNT3O95395 438 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 HOXD13P35453 343 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 CPXCR1Q8N123 301 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 FZD1Q9UP38 647 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.54■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 ERLIN2O94905 339 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 SLC12A3P55017 1021 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 GIT2Q14161 759 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 CASP8Q14790 479 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 EFCAB13Q8IY85 973 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 NYAP2Q9P242 653 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 hCG_1984214I3L0E3 225 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 LRRC63Q05C16 580 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 KCNH2Q12809 1159 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 GBP6Q6ZN66 633 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 RABEP2Q9H5N1 569 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 DNM3Q9UQ16 869 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 SLX4Q8IY92 1834 aa16.53■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 A0A087X0T9 212 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 TMEM150BA6NC51 233 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 FAM228BP0C875 321 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 TATDN1Q6P1N9 297 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 LRRC31Q6UY01 552 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 WDR18Q9BV38 432 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 L1RE1Q9UN81 338 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 ESYT3A0FGR9 886 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 HGSNATQ68CP4 663 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 PDXDC1Q6P996 788 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 DYDC2Q96IM9 177 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CTIF-205ENST00000587860 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.52■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 SORBS3O60504 671 aa16.52■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 AKAP3O75969 853 aa16.52■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16.52■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 TISP43B9A030 160 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 LRRN2O75325 713 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 RETREG2Q8NC44 543 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 DCAF4Q8WV16 495 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 IDI2Q9BXS1 227 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 EHD4Q9H223 541 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 SH2D4AQ9H788 454 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 KLRC1P26715 233 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 BRD3Q15059 726 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 MKL1Q969V6 931 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 BORCS6Q96GS4 357 aa16.51■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 ATP8B1O43520 1251 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 ARP10275 920 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 NT5C2P49902 561 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R18Q6NYC8 613 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 AGBL1Q96MI9 1066 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 MYO1AQ9UBC5 1043 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 USO1O60763 962 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 CALRP27797 417 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 USP11P51784 963 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 STAT2P52630 851 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 USP14P54578 494 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 MYCT1Q8N699 235 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 MIEF2Q96C03 454 aa16.5■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 EGFRP00533 1210 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 TRADDQ15628 312 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 CREG2Q8IUH2 290 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 RAB21Q9UL25 225 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 ABCB11O95342 1321 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 TACC1O75410 805 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 PALMO75781 387 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 CYP2J2P51589 502 aa16.49■□□□□ 0.23
CTIF-205ENST00000587860 INHBEP58166 350 aa16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms