RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577500.5

LLGL2-207, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene LLGL2, Length 2,971 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-207ENST00000577500 ICE2Q659A1 982 aa14.68□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.68□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.68□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 SEPT2Q15019 361 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 SLF2Q8IX21 1173 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 E7EVH7 732 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 MYO1FO00160 1098 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 DAPK3O43293 454 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 GFPT2O94808 682 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 TMOD1P28289 359 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 USP11P51784 963 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 MARSP56192 900 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 BHMT2Q9H2M3 363 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 DPH5Q9H2P9 285 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 RGL1Q9NZL6 768 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 KRIT1O00522 736 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 GCNT3O95395 438 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.064e-8■■■■□ 20.6
LLGL2-207ENST00000577500 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 HYIQ5T013 277 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 PEX26Q7Z412 305 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 DAAM2Q86T65 1068 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 GCNT4Q9P109 453 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 NR2E1Q9Y466 385 aa14.67□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ZBTB39O15060 712 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 PPP1R37O75864 691 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 SERPINB2P05120 415 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ABCB4P21439 1286 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ARHGAP4P98171 946 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 WHAMMQ8TF30 809 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 RUSC1Q9BVN2 902 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 FAM86B1E9PN63 330 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 MEIS2O14770 477 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 TTI1O43156 1089 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 CCT8L2Q96SF2 557 aa14.66□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 MDH1P40925 334 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 PTGISQ16647 500 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ISCUQ9H1K1 167 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 EPN3Q9H201 632 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 DNM3Q9UQ16 869 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 H0YHG0 523 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 NR3C1P04150 777 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 IFT88Q13099 833 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 ODF2Q5BJF6 829 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 MREGQ8N565 214 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 SCFD2Q8WU76 684 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 DNAJC18Q9H819 358 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 NRAPQ86VF7 1730 aa14.65□□□□□ -0.06
LLGL2-207ENST00000577500 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.64□□□□□ -0.07
LLGL2-207ENST00000577500 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LLGL2-207ENST00000577500 CHMP2AO43633 222 aa14.64□□□□□ -0.07
LLGL2-207ENST00000577500 KIAA0754O94854 1291 aa14.64□□□□□ -0.07
LLGL2-207ENST00000577500 CPP00450 1065 aa14.64□□□□□ -0.07
LLGL2-207ENST00000577500 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LLGL2-207ENST00000577500 COG2Q14746 738 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms