RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	GALNT17	Q6IS24	598 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	BLID	Q8IZY5	108 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TBCK	Q8TEA7	893 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SAMM50	Q9Y512	469 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		10.65	□□□□□ -0.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TET1	Q8NFU7	2136 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01553	A4QN01	128 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	MSH4	O15457	936 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	EDIL3	O43854	480 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	PFKFB2	O60825	505 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	XBP1	P17861	261 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	GRB10	Q13322	594 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRED2	Q7Z698	418 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	LENG9	Q96B70	501 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	AIFM3	Q96NN9	605 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	YME1L1	Q96TA2	773 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	RIT2	Q99578	217 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	THEG	Q9P2T0	379 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		10.64	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CDH23	Q9H251	3354 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR64	B1ANS9	1081 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479		M0R2N6	131 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	GAS7	O60861	476 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP4A	P20648	1035 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CD52	P31358	61 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	AK2	P54819	239 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479		Q4G0T1	1027 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT40	Q6A162	431 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	IL17RA	Q96F46	866 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	SAMD11	Q96NU1	681 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	ASB2	Q96Q27	587 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	DISC1	Q9NRI5	854 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	COL1A2	P08123	1366 aa		10.63	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	LPXN	O60711	386 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP3A7	P24462	503 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	SFN	P31947	248 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71	3e-6	■■■■□ 25.6
KIFC3-231	ENST00000567479	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	WASF1	Q92558	559 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	GINS2	Q9Y248	185 aa		10.62	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	MAGEB2	O15479	319 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CHMP2A	O43633	222 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	PSMD10	O75832	226 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TDP2	O95551	362 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	NEK4	P51957	841 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	JAK3	P52333	1124 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KIFC3-231	ENST00000567479	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71

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