RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TTC1	Q99614	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ATF2	P15336	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PML	P29590	882 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	STAT5A	P42229	794 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SEC23A	Q15436	765 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF174	Q15697	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	TOMM22	Q9NS69	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	EYA4	O95677	639 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	BPI	P17213	487 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SLC9A1	P19634	815 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	GJA4	P35212	333 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	MC3R	P41968	323 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	LSS	P48449	732 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	EPHA5	P54756	1037 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FOXO4	P98177	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	OCRL	Q01968	901 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	COG1	Q8WTW3	980 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.53	□□□□□ -1.68
BBS2-208	ENST00000564123	ACOT7	O00154	380 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	DVL2	O14641	736 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	GPR39	O43194	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	ZEB2	O60315	1214 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	BRINP1	O60477	761 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	ASGR2	P07307	311 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	VWA3B	Q502W6	1294 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	UBXN11	Q5T124	520 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		4.52	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	FOXP2	O15409	715 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	LRG1	P02750	347 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	MME	P08473	750 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	FAH	P16930	419 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	DDB1	Q16531	1140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	DLG3	Q92796	817 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	SLC5A5	Q92911	643 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	GPR20	Q99678	358 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		4.51	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.5	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.5	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	TGM5	O43548	720 aa		4.5	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	KATNA1	O75449	491 aa		4.5	□□□□□ -1.69
BBS2-208	ENST00000564123	C8B	P07358	591 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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