RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 TMEM260Q9NX78 707 aa18.5■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa18.5■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYO15AQ9UKN7 3530 aa18.5■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 MEIS1O00470 390 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 DHX15O43143 795 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 MGEA5O60502 916 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDC27P30260 824 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 GATMP50440 423 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDHR5Q9HBB8 845 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 CLDND1Q9NY35 253 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 PADI3Q9ULW8 664 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 SQORQ9Y6N5 450 aa18.49■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 MMP1P03956 469 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ITGB1P05556 798 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATP4AP20648 1035 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 SREBF1P36956 1147 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEP55Q53EZ4 464 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ANO3Q9BYT9 981 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ANO2Q9NQ90 1003 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLAGL2Q9UPG8 496 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRPV2Q9Y5S1 764 aa18.48■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRR33A8MZF0 331 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM86B1E9PN63 330 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM86B2P0C5J1 330 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 IRS1P35568 1242 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPP1R18Q6NYC8 613 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABHD15Q6UXT9 468 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 RSPH3Q86UC2 560 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.47■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 MBTPS2O43462 519 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 EDIL3O43854 480 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 STAT5BP51692 787 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 NAPAP54920 295 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADAM15Q13444 863 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 P2RX5Q93086 422 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLVAPQ9BX97 442 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 BARHL2Q9NY43 387 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRKAG3Q9UGI9 489 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 RWDD3Q9Y3V2 267 aa18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 KMT2EQ8IZD2 1858 aa18.46■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 CLUL1Q15846 466 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 NEK1Q96PY6 1258 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 CLEC1BQ9P126 229 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 HCSTQ9UBK5 93 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRPC6Q9Y210 931 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa18.45■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 SMCO2A6NFE2 343 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 CSPG5O95196 566 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 GLP2RO95838 553 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADCY7P51828 1080 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 RTN1Q16799 776 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 IER5Q5VY09 327 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 AZI2Q9H6S1 392 aa18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 NID2Q14112 1375 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZBTB43O43298 467 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 DCXO43602 365 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 FOSP01100 380 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 SCG2P13521 617 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 CPA1P15085 419 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 KLRC1P26715 233 aa18.43■□□□□ 0.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 AP3B2Q13367 1082 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms