RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 CIITAP33076 1130 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 PTK2Q05397 1052 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 EDRF1Q3B7T1 1238 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 NOX5Q96PH1 765 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 VEZTQ9HBM0 779 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.3■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 SLITRK3O94933 977 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 HPCAL4Q9UM19 191 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 NR3C1P04150 777 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.29■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 SYF2O95926 243 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 PON1P27169 355 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 ASIC2Q16515 512 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 SLC18A3Q16572 532 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 ARP10275 920 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 UCHL3P15374 230 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC181Q5TID7 509 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 BCS1LQ9Y276 419 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 TGFB1I1O43294 461 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 SPDYE6P0CI01 402 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 GPS2Q13227 327 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 DGKZQ13574 1117 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 MYCT1Q8N699 235 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM260-216ENST00000557657 EYA4O95677 639 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 CNKSR1Q969H4 720 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 SPAG5Q96R06 1193 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 PLS1Q14651 629 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 MMGT1Q8N4V1 131 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 PSMD10O75832 226 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 TUBBP07437 444 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 GGCXP38435 758 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 NAB2Q15742 525 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 SLC35C1Q96A29 364 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 TMX2Q9Y320 296 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 PDXKO00764 312 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 CYP3A4P08684 503 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 HSP90B2PQ58FF3 399 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 BANK1Q8NDB2 785 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 ESYT3A0FGR9 886 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 PIK3CDO00329 1044 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 RNF40O75150 1001 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 EPHA7Q15375 998 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 SIX2Q9NPC8 291 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 CNTNAP1P78357 1384 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 AGPSO00116 658 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 CALUO43852 315 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 FAM13AO94988 1023 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 POLR2MP0CAP2 368 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 PRLRP16471 622 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM260-216ENST00000557657 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms