RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555436.1

CBLN3-202, Transcript of cerebellin 3 precursor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CBLN3, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3-202ENST00000555436 PDXDC2PQ6P474 469 aa22.06■■□□□ 1.12
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CBLN3-202ENST00000555436 TOP1MTQ969P6 601 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.06■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 CDKL5O76039 1030 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 ERVK-21P61565 698 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 IER5Q5VY09 327 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 GALNT17Q6IS24 598 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 TBCKQ8TEA7 893 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 IL17RAQ96F46 866 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 AIFM3Q96NN9 605 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.05■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.04■■□□□ 1.12
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CBLN3-202ENST00000555436 PFKFB2O60825 505 aa22.04■■□□□ 1.12
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CBLN3-202ENST00000555436 GRB10Q13322 594 aa22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 ANKRD1Q15327 319 aa22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 NPY5RQ15761 445 aa22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 BLIDQ8IZY5 108 aa22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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CBLN3-202ENST00000555436 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 SQORQ9Y6N5 450 aa22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 KAT6AQ92794 2004 aa22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 VCANP13611 3396 aa22.04■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 COL1A2P08123 1366 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 M0QZ92 97 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 MSH4O15457 936 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 LPXNO60711 386 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 PSAPP07602 524 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 ATP4AP20648 1035 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 KLRC1P26715 233 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 NME8Q8N427 588 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 RIT2Q99578 217 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 THEGQ9P2T0 379 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.03■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 TRANK1O15050 2925 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 WDR64B1ANS9 1081 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 UPP2O95045 317 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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CBLN3-202ENST00000555436 SLC5A5Q92911 643 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 YME1L1Q96TA2 773 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.02■■□□□ 1.12
CBLN3-202ENST00000555436 STK36Q9NRP7 1315 aa22.02■■□□□ 1.12
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CBLN3-202ENST00000555436 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 CYP3A7P24462 503 aa22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 AK2P54819 239 aa22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.01■■□□□ 1.11
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CBLN3-202ENST00000555436 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 KRT40Q6A162 431 aa22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 SAMM50Q9Y512 469 aa22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.01■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 ENPP3O14638 875 aa22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 GAS7O60861 476 aa22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 CD52P31358 61 aa22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22■■□□□ 1.11
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CBLN3-202ENST00000555436 PHF20Q9BVI0 1012 aa22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 DISC1Q9NRI5 854 aa22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 LMCD1Q9NZU5 365 aa22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa22■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 TDP2O95551 362 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 XBP1P17861 261 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 FAM167AQ96KS9 214 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 MBOAT7Q96N66 472 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 FTHL17Q9BXU8 183 aa21.99■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 PSMD10O75832 226 aa21.98■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 CTDNEP1O95476 244 aa21.98■■□□□ 1.11
CBLN3-202ENST00000555436 C22orf31O95567 290 aa21.98■■□□□ 1.11
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