RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	CPA1	P15085	419 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	RPS6KB1	P23443	525 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CD52	P31358	61 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	LIFR	P42702	1097 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	PGM5	Q15124	567 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	KANK3	Q6NY19	840 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	RUFY3	Q7L099	469 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	TMTC2	Q8N394	836 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	FAM186A	A6NE01	2351 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		15.88	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	SEMA3F	Q13275	785 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	FBXL16	Q8N461	479 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	PLVAP	Q9BX97	442 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		15.87	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	TEC	P42680	631 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	HSD17B4	P51659	736 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	P2RX5	Q93086	422 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	GPR20	Q99678	358 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		15.86	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	MARK3	P27448	753 aa		15.85	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	TROAP	Q12815	778 aa		15.85	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	DUSP6	Q16828	381 aa		15.85	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		15.85	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	KIF2C	Q99661	725 aa		15.85	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	TTC3	P53804	2025 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CCDC69	A6NI79	296 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CAND2	O75155	1236 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222		Q6ZUG5	572 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	PNMA2	Q9UL42	364 aa		15.84	■□□□□ 0.13
CS-231	ENST00000552222	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	HIDE1	A8MVS5	230 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	DDAH1	O94760	285 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	IGBP1	P78318	339 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	KCNC3	Q14003	757 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	FLCN	Q8NFG4	579 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MAP3K14	Q99558	947 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TMX1	Q9H3N1	280 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	POMK	Q9H5K3	350 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		15.83	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	PBX3	P40426	434 aa		15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	FGD1	P98174	961 aa		15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	GRM4	Q14833	912 aa		15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	APOA5	Q6Q788	366 aa		15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	BRF1	Q92994	677 aa		15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		15.82	■□□□□ 0.12
CS-231	ENST00000552222	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		15.82	■□□□□ 0.12

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