RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 MMEP08473 750 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PDE6AP16499 860 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CTNNA2P26232 953 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CALML6Q8TD86 181 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CENPTQ96BT3 561 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CATSPER2Q96P56 530 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 OPHN1O60890 802 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ZAP70P43403 619 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 MTTPP55157 894 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 AOC3Q16853 763 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 RGMBQ6NW40 437 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PACS2Q86VP3 889 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 DCLK2Q8N568 766 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 EURLQ9NYK6 297 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 DNM3Q9UQ16 869 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0G2JLW4 131 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SNTNA6NMZ2 147 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 H7C1W4 665 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 COBLO75128 1261 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D8O95759 1140 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 FCER1AP12319 257 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 KRT6CP48668 564 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ASPHQ12797 758 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf194Q5TEA3 1177 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SSH3Q8TE77 659 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 LPAR1Q92633 364 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD27Q96NW4 1050 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PPCSQ9HAB8 311 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CD209Q9NNX6 404 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CROTQ9UKG9 612 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 MAFFQ9ULX9 164 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 GNRH1P01148 92 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 IL4RP24394 825 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3CAP42336 1068 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 STX17P56962 302 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 IQUBQ8NA54 791 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ESRRBO95718 433 aa6.8□□□□□ -1.32
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PTPRB-210ENST00000551525 PRLP01236 227 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 NFKBIAP25963 317 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SOX10P56693 466 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 GNGT1P63211 74 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ASIC1P78348 528 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 GUCY1B3Q02153 619 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC14Q49A88 953 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZUG5 572 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ELMOD1Q8N336 334 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 TSPYL6Q8N831 410 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 RBSNQ9H1K0 784 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ABCB11O95342 1321 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB8A8MWE9 144 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PDE5AO76074 875 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USH1GQ495M9 461 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 HIC2Q96JB3 615 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SLF1Q9BQI6 1058 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 F8VZ95 297 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 EPB41P11171 864 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 NAT2P11245 290 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 TTLL4Q14679 1199 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SURF1Q15526 300 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 NBPF26B4DH59 902 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L12C9JPN9 530 aa6.79□□□□□ -1.32
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