RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545344.5

TM7SF3-218, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TM7SF3-218ENST00000545344 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.5□□□□□ -0.89
TM7SF3-218ENST00000545344 MYLIPQ8WY64 445 aa9.5□□□□□ -0.89
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