RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 CKBP12277 381 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 SELPP16109 830 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 SYT1P21579 422 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 PRKCEQ02156 737 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 EPHA7Q15375 998 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF174Q15697 407 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 UGCGQ16739 394 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 CKAP2LQ8IYA6 745 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 WNT8BQ93098 351 aa20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 SCN5AQ14524 2016 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 LAD1O00515 517 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 IQCF3P0C7M6 154 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 CSF2RAP15509 400 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 CCL23P55773 120 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 PSMC5P62195 406 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 TDHQ8IZJ6 230 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 NEK9Q8TD19 979 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 IL23AQ9NPF7 189 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.67■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 ZBTB42B2RXF5 422 aa20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 TXKP42681 527 aa20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 QARSP47897 775 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 NBR1Q14596 966 aa20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 NRBP2Q9NSY0 501 aa20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.66■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 IGBP1P78318 339 aa20.65■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 XKR3Q5GH77 459 aa20.65■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.65■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.65■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 SCLYQ96I15 445 aa20.65■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.65■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 SIP14410 1827 aa20.64■□□□□ 0.9
COPS7A-216ENST00000543170 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 STX6O43752 255 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 THPOP40225 353 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 PRPHP41219 470 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 EPHB4P54760 987 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 FAM26DQ5JW98 314 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 RSPH3Q86UC2 560 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 C4orf19Q8IY42 314 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 BANK1Q8NDB2 785 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 LXNQ9BS40 222 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 MTMR6Q9Y217 621 aa20.64■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 POTEMA6NI47 508 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 STBD1O95210 358 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 C22orf31O95567 290 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 CXCL10P02778 98 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 RESTQ13127 1097 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 PTGDRQ13258 359 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 VWCEQ96DN2 955 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 PPME1Q9Y570 386 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.63■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 ARID2Q68CP9 1835 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 EVPLQ92817 2033 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 MAGEB2O15479 319 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 LYPLA2O95372 231 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 BMP15O95972 392 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 RSPH10BP0C881 870 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 KLRC1P26715 233 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM240Q5SV17 173 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 TET1Q8NFU7 2136 aa20.62■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 TECP42680 631 aa20.61■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 MGAT3Q09327 533 aa20.61■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.61■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 FERMT3Q86UX7 667 aa20.61■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 NME8Q8N427 588 aa20.61■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.61■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 DYDC2Q96IM9 177 aa20.61■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 RAB34Q9BZG1 259 aa20.61■□□□□ 0.89
COPS7A-216ENST00000543170 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms