RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 MYO7AQ13402 2215 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 COL4A6Q14031 1691 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 POTEB3A0JP26 581 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BNC9 293 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 KLRC1P26715 233 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CD52P31358 61 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF76P36508 570 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC26A2P50443 739 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CCT2P78371 535 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 FGD1P98174 961 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 POTEBQ6S5H4 581 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 RSPH3Q86UC2 560 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM192Q8IY95 271 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 HLA-CQ95604 372 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TMX1Q9H3N1 280 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 AZI2Q9H6S1 392 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 C6orf50Q9HD87 102 aa13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R2N6 131 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 DGKIO75912 1065 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 REC8O95072 547 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 PSMA5P28066 241 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM62Q0P6H9 643 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 NPY5RQ15761 445 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IER5Q5VY09 327 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SWSAP1Q6NVH7 229 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 NME8Q8N427 588 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP8B4Q8TF62 1192 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IL17RAQ96F46 866 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 YME1L1Q96TA2 773 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC26A6Q9BXS9 759 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TM6SF1Q9BZW5 370 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 VPS54Q9P1Q0 977 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 PADI3Q9ULW8 664 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TRPC6Q9Y210 931 aa13.43□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 C5orf67F2Z3F1 127 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 HBP1O60381 514 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 GNA11P29992 359 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 COL19A1Q14993 1142 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 AAK1Q2M2I8 961 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MCTP2Q6DN12 878 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM40Q8WWA1 233 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SAMD11Q96NU1 681 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF577Q9BSK1 485 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF302Q9NR11 478 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SH3GLB2Q9NR46 395 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TBC1D22BQ9NU19 505 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TRPV2Q9Y5S1 764 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.42□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 EVPLQ92817 2033 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 BMPR1AP36894 532 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 USP11P51784 963 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 GPM6BQ13491 265 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CAMK1Q14012 370 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR16Q569H4 304 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ERVK-5Q9HDB9 667 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 CD320Q9NPF0 282 aa13.41□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 BACH1O14867 736 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MSH4O15457 936 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF862O60290 1169 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 MGEA5O60502 916 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 GPR32O75388 356 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 STBD1O95210 358 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 C22orf31O95567 290 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SETQ01105 290 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 KRT76Q01546 638 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM160B1Q5W0V3 765 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 PDXDC2PQ6P474 469 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 B3GNT9Q6UX72 402 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 FIBCD1Q8N539 461 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01465Q8N7H1 131 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC5A5Q92911 643 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 GJA10Q969M2 543 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 AIFM3Q96NN9 605 aa13.4□□□□□ -0.26
CLSTN3-211ENST00000541667 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms