RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 ERVK-21P61565 698 aa28.31■■■□□ 2.12
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PTPRJ-206ENST00000534219 DEXIO95424 95 aa28.3■■■□□ 2.12
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PTPRJ-206ENST00000534219 SAMD11Q96NU1 681 aa28.22■■■□□ 2.11
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PTPRJ-206ENST00000534219 MICAL3Q7RTP6 2002 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRJ-206ENST00000534219 KAT6AQ92794 2004 aa28.21■■■□□ 2.11
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PTPRJ-206ENST00000534219 DAGLBQ8NCG7 672 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-206ENST00000534219 TEKT3Q9BXF9 490 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRJ-206ENST00000534219 ZBTB42B2RXF5 422 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-206ENST00000534219 M0R2N6 131 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-206ENST00000534219 PFKFB2O60825 505 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRJ-206ENST00000534219 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.12e-8■■■■■ 28.9
PTPRJ-206ENST00000534219 Q4G0T1 1027 aa28.19■■■□□ 2.1
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