RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 IL13RA1P78552 427 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 FOXL1Q12952 345 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 CFHR4Q92496 578 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 TLR9Q9NR96 1032 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 TRAF6Q9Y4K3 522 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 A0A087X1B8 175 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 IQCA1LA6NCM1 817 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 PDE6AP16499 860 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 INHBCP55103 352 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 NFYCQ13952 458 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 PTGS1P23219 599 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 TUBA3CQ13748 450 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 MAN2B1O00754 1011 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 ADH4P08319 380 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 MC4RP32245 332 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 USP30Q70CQ3 517 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF575Q86XF7 245 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 INCENPQ9NQS7 918 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 KRT15P19012 456 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 PAK1Q13153 545 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 PCOLCEQ15113 449 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 GPR19Q15760 415 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 OTOP2Q7RTS6 562 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 GALNT8Q9NY28 637 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 AMY2AP04746 511 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 AMY2BP19961 511 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 ARID5AQ03989 594 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 OSTM1Q86WC4 334 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 GPR135Q8IZ08 494 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-220ENST00000531466 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRK-220ENST00000531466 KCNK3O14649 394 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 DPH6Q7L8W6 267 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 OR10A2Q9H208 303 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 BTBD7Q9P203 1132 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRK-220ENST00000531466 PYGMP11217 842 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 AOAHP28039 575 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 MEOX1P50221 254 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 CD83Q01151 205 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 HHEXQ03014 270 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 GRM7Q14831 915 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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PTPRK-220ENST00000531466 FIGNQ5HY92 759 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 LRSAM1Q6UWE0 723 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 D2HGDHQ8N465 521 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 FBXW5Q969U6 566 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 WNK4Q96J92 1243 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 CBLCQ9ULV8 474 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 MAKP20794 623 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 GJA4P35212 333 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 JAM2P57087 298 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF627Q7L945 461 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 TINF2Q9BSI4 451 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 NELFAQ9H3P2 528 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-220ENST00000531466 UCKL1Q9NWZ5 548 aa7.31□□□□□ -1.24
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