RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 PSMC6P62333 389 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ASIC1P78348 528 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 BANK1Q8NDB2 785 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SCFD2Q8WU76 684 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MAML3Q96JK9 1138 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 BPIFA3Q9BQP9 254 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 BCAS3Q9H6U6 928 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 CBX8Q9HC52 389 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 VTA1Q9NP79 307 aa11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 KLRC4O43908 158 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 RHOBTB3O94955 611 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ATG7O95352 703 aa11.62□□□□□ -0.55
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TRPS1-210ENST00000519815 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 CYP11B2P19099 503 aa11.62□□□□□ -0.55
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TRPS1-210ENST00000519815 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 TTLL4Q14679 1199 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 LY6KQ17RY6 165 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC62Q6P9F0 684 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 DYMQ7RTS9 669 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 GPBP1Q86WP2 473 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 C4orf19Q8IY42 314 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 NPLOC4Q8TAT6 608 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 USP6NLQ92738 828 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ATP6V0A1Q93050 837 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 TINF2Q9BSI4 451 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 EXOC1Q9NV70 894 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 LCTP09848 1927 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SMTNL1A8MU46 457 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 BECN2A8MW95 431 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 GGPS1O95749 300 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRPS1-210ENST00000519815 RGS2P41220 211 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRPS1-210ENST00000519815 SP4Q02446 784 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRPS1-210ENST00000519815 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 METTL7BQ6UX53 244 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRPS1-210ENST00000519815 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 KCND2Q9NZV8 630 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 GJD2Q9UKL4 321 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 BACH1O14867 736 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ZBTB39O15060 712 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 SORBS3O60504 671 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ARIH2O95376 493 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 TBC1D8O95759 1140 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 YWHABP31946 246 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 PSMC4P43686 418 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 KIF22Q14807 665 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 IQCB1Q15051 598 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ARSHQ5FYA8 562 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 OTUD6AQ7L8S5 288 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 LUZP1Q86V48 1076 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 ANKEF1Q9NU02 776 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 PANK4Q9NVE7 773 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-210ENST00000519815 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.59□□□□□ -0.55
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