RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519028.1

TNFRSF10B-204, Transcript of TNF receptor superfamily member 10b, humanhuman

TSL 2

Gene TNFRSF10B, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TDHQ8IZJ6 230 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 IL23AQ9NPF7 189 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.01■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ZBTB42B2RXF5 422 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ACRP10323 421 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 SYT1P21579 422 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 THPOP40225 353 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 GPNMBQ14956 572 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 EPHA7Q15375 998 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 SHHQ15465 462 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 C9orf50Q5SZB4 431 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ZBTB10Q96DT7 871 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 STBD1O95210 358 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ZNF484Q5JVG2 852 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TMEM240Q5SV17 173 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RPAINQ86UA6 219 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 BANK1Q8NDB2 785 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.272e-13■□□□□ 9
TNFRSF10B-204ENST00000519028 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 SCN5AQ14524 2016 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 COL1A2P08123 1366 aa22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 OATP04181 439 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 KLRC1P26715 233 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RFC2P35250 354 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PRKCEQ02156 737 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ZNF365Q70YC5 407 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 FAM167AQ96KS9 214 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CAND2O75155 1236 aa22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 OR52Z1P0C646 297 aa22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PSMC5P62195 406 aa22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RSPH10B2B2RC85 870 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RSPH10BP0C881 870 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PTGDRQ13258 359 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 XKR3Q5GH77 459 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RGL1Q9NZL6 768 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 LAMA3Q16787 3333 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF10B-204ENST00000519028 NBNO60934 754 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 SLITRK3O94933 977 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 FGBP02675 491 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TECP42680 631 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 MBTPS1Q14703 1052 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 FAM26DQ5JW98 314 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 BRAPQ7Z569 592 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 DYDC2Q96IM9 177 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 C22orf31O95567 290 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CHRNA1P02708 482 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CXCL10P02778 98 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PFKMP08237 780 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 ANO5Q75V66 913 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 FERMT3Q86UX7 667 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CEP89Q96ST8 783 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 MTMR6Q9Y217 621 aa22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TET1Q8NFU7 2136 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 TMEM150BA6NC51 233 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 POTEMA6NI47 508 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 STX6O43752 255 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CTSHP09668 335 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CYP4A11Q02928 519 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RASIP1Q5U651 963 aa22.93■■□□□ 1.26
TNFRSF10B-204ENST00000519028 RSPH3Q86UC2 560 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms