RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BTBD7Q9P203 1132 aa1.92□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa1.92□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa1.92□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ASXL2Q76L83 1435 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PQU0 124 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BLACEA4D250 179 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CAPN14A8MX76 684 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMNAP02545 664 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRK2P25098 689 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRK3P35626 688 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ITGAEP38570 1179 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS19P39019 145 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRE11P49959 708 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTTG1IPP53801 180 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PPP2R2AP63151 447 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAM8P78325 824 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBM10P98175 930 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAP4K2Q12851 820 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRM7Q14831 915 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEC23AQ15436 765 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STILQ15468 1287 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC10A6Q3KNW5 377 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TM4SF20Q53R12 229 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZMAT1Q5H9K5 638 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1QL3Q5VWW1 255 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KANK2Q63ZY3 851 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LAIR1Q6GTX8 287 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FSTL4Q6MZW2 842 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRSAM1Q6UWE0 723 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LBX2Q6XYB7 198 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCTD1Q719H9 257 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRP10Q7Z4F1 713 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM178BQ8IXR5 827 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF654Q8IZM8 581 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANAPC16Q96DE5 110 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRRX2Q99811 253 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMNQ9BXJ7 453 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SYNPO2LQ9H987 977 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GIT1Q9Y2X7 761 aa1.91□□□□□ -2.1
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GRXCR1A8MXD5 290 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAFKO60675 156 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HMGCRP04035 888 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMY2AP04746 511 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAT2P11245 290 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GNAT1P11488 350 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AMY2BP19961 511 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CLK3P49761 638 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STAT5BP51692 787 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C21orf58P58505 322 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ST5P78524 1137 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR72Q3MJ13 1102 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF568Q3ZCX4 644 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP30Q70CQ3 517 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP53Q70EK8 1073 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GAREM2Q75VX8 874 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SGMS1Q86VZ5 419 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 D2HGDHQ8N465 521 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SHCBP1Q8NEM2 672 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC140Q96MF4 163 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IER2Q9BTL4 223 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IPPKQ9H8X2 491 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DSEQ9UL01 958 aa1.9□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MASP2O00187 686 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MAN2B1O00754 1011 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNK3O14649 394 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC26A4O43511 780 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM20BO75063 409 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUDT3O95989 172 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GCP02774 474 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SOD2P04179 222 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RABGGTBP53611 331 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD83Q01151 205 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RIN1Q13671 783 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM200BQ69YZ2 307 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BHLHA9Q7RTU4 235 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OSBP2Q969R2 916 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCYL1Q96KG9 808 aa1.89□□□□□ -2.11
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10A2Q9H208 303 aa1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms