RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 DLL4Q9NR61 685 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNH7Q9NS40 1196 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPTLC3Q9NUV7 552 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 OXSMQ9NWU1 459 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUB1Q9Y5A7 615 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 H7C1D1 291 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 FOXP2O15409 715 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 TGM5O43548 720 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIP1RO75146 1068 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF28P17035 718 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTGS1P23219 599 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPL13P26373 211 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 GJA4P35212 333 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 IL13P35225 146 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADCY8P40145 1251 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADCYAP1R1P41586 468 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SARSP49591 514 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 IL13RA1P78552 427 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 STRN3Q13033 797 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTLL7Q6ZT98 887 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTLL6Q8N841 843 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMC1BQ8NDV3 1235 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIPK4Q8NE63 616 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUDT11Q96G61 164 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM209Q96SK2 561 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEMA4AQ9H3S1 761 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 TOMM22Q9NS69 142 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCND1Q9NSA2 647 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 NTMQ9P121 344 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA6L22H0YM25 854 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 NEMP1O14524 444 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 GAS7O60861 476 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXO21O94952 628 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 KNG1P01042 644 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SDHAP31040 664 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 STAT3P40763 770 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNC1P48547 511 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 RGS3P49796 1198 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 HERVK_113P62684 666 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 RGL3Q3MIN7 710 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM151BQ8IW70 566 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 C16orf92Q96LL3 132 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNC2Q96PR1 638 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 XYLT2Q9H1B5 865 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADAM7Q9H2U9 754 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCIF1Q9H4Z3 704 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 WDR26Q9H7D7 661 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 INCENPQ9NQS7 918 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFT57Q9NWB7 429 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOBOXO60393 691 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLHL18O94889 574 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 FKBP9O95302 570 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 INHBBP09529 407 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ECE1P42892 770 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCNN1BP51168 640 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 IL2P60568 153 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD83Q01151 205 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 CAP1Q01518 475 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC6A3Q01959 620 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYBPC3Q14896 1274 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF174Q15697 407 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGAP44Q17R89 818 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 FKBP9P1Q75LS8 142 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPR155Q7Z3F1 870 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIF18BQ86Y91 864 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-344P-201ENST00000516635 POFUT1Q9H488 388 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms