RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADMP35318 185 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIM14Q14142 442 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEC23AQ15436 765 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP45Q70EL2 814 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC138Q96M89 665 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RSAD1Q9HA92 442 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ANAPC4Q9UJX5 808 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 POLHQ9Y253 713 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IPPQ9Y573 584 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM82A0PJX8 343 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM227AF5H4B4 570 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIK3R2O00459 728 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HRGP04196 525 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LPLP06858 475 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM193AP78312 1265 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SEMA5AQ13591 1074 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRT72Q14CN4 511 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DENND1CQ8IV53 801 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NME8Q8N427 588 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SVOPQ8N4V2 548 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GATA6Q92908 595 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBE2FQ969M7 185 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGBD4Q96DM1 585 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SGCZQ96LD1 299 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C16orf92Q96LL3 132 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.08□□□□□ -1.44
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 UBXN7O94888 489 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TYRP1P17643 537 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TM4SF4P48230 202 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EPHA7Q15375 998 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PGS1Q32NB8 556 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNK18Q7Z418 384 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CREG2Q8IUH2 290 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SHISA5Q8N114 240 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COA7Q96BR5 231 aa6.07□□□□□ -1.44
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 U3KQE9 123 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 X6R8D5 127 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM170BA6NMN3 283 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C9orf172C9J069 976 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 KRIT1O00522 736 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 B3GALT2O43825 422 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC5A3P53794 718 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 BIRC3Q13489 604 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MOGSQ13724 837 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GAB4Q2WGN9 574 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ALFQ53S48 1182 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RNF220Q5VTB9 566 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPNTQ6UXI9 565 aa6.06□□□□□ -1.44
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