RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515964.1

RNU6-1129P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1129, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1129P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CHGBP05060 677 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 HERVK_113P62684 666 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 Q6ZUG5 572 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 HOMER1Q86YM7 354 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 WDR48Q8TAF3 677 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GBP4Q96PP9 640 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FANCLQ9NW38 375 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BTBD7Q9P203 1132 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LAMTOR5O43504 91 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ADCY8P40145 1251 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IL13RA1P78552 427 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TCEA2Q15560 299 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ASB15Q8WXK1 588 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BOCQ9BWV1 1114 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CABP5Q9NP86 173 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GALNT8Q9NY28 637 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RASSF10A6NK89 507 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ITGB3P05106 788 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 JMJD7P0C870 316 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CSF2RBP32927 897 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 FLT3P36888 993 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RRADP55042 308 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SURF1Q15526 300 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CHST14Q8NCH0 376 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 APPBP2Q92624 585 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DLG3Q92796 817 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 LOXL4Q96JB6 756 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MPIG6BO95866 241 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 POLD1P28340 1107 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KIF11P52732 1056 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TKFCQ3LXA3 575 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 AJUBAQ96IF1 538 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 AMNQ9BXJ7 453 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ECE1P42892 770 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KCNQ1P51787 676 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PPP2CBP62714 309 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PPP2CAP67775 309 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ZNF827Q17R98 1081 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CFAP100Q494V2 611 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 WNK4Q96J92 1243 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PTPN18Q99952 460 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ASB1Q9Y576 335 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 H7C1D1 291 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TRAF5O00463 557 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 KPNA6O60684 536 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CUTAO60888 179 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CDC45O75419 566 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RFPL3O75679 317 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SDHAP31040 664 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 NEK4P51957 841 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CD83Q01151 205 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SPATS1Q496A3 300 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 BTBD2Q9BX70 525 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 OR10A5Q9H207 317 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 DVL2O14641 736 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 HMGCRP04035 888 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 EFEMP1Q12805 493 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-1129P-201ENST00000515964 ZNF174Q15697 407 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms