RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511574.5

CEP63-209, Transcript of centrosomal protein 63, human

TSL 4

Gene CEP63, Length 629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP63-209	ENST00000511574	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CEP63-209	ENST00000511574	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PEX14	O75381	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	ITGB3	P05106	788 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	NTRK3	Q16288	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	LBX2	Q6XYB7	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	FAM124A	Q86V42	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	JAM3	Q9BX67	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	CYP7B1	O75881	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PLAT	P00750	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PAX7	P23759	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	GRK2	P25098	689 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	GRK3	P35626	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	CBX1	P83916	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	MCTP2	Q6DN12	878 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	LGI4	Q8N135	537 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	FEZ1	Q99689	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	SMARCA2	P51531	1590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	SLC27A2	O14975	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	IL13	P35225	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	GPR85	P60893	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PMM1	Q92871	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	INVS	Q9Y283	1065 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	MCM5	P33992	734 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	COPB2	P35606	906 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	BIRC2	Q13490	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CEP63-209	ENST00000511574	SDE2	Q6IQ49	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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