RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TCHHQ07283 1943 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 E7EVH7 732 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 YEATS4O95619 227 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CRYZL1O95825 349 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HSD17B4P51659 736 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PLTPP55058 493 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MAP3K7CLP57077 242 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CD83Q01151 205 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GUCY2DQ02846 1103 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MVPQ14764 893 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CEP95Q96GE4 821 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CD93Q9NPY3 652 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PLAAQ9Y263 795 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DISP1Q96F81 1524 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FKBP9O95302 570 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CACNA2D1P54289 1103 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FLIIQ13045 1269 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MTX1Q13505 466 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC102BQ68D86 513 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CYP4X1Q8N118 509 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ACAP3Q96P50 834 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MXD3Q9BW11 206 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GID8Q9NWU2 228 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GMIPQ9P107 970 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 E9PCH4 1651 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PFKFB2O60825 505 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 KATNA1O75449 491 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FYNP06241 537 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SERPINB3P29508 390 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 IFNA8P32881 189 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 COPAP53621 1224 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 NFIAQ12857 509 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MAPRE2Q15555 327 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 EMC3Q9P0I2 261 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 USP47Q96K76 1375 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 FMN1Q68DA7 1419 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SYCE1LA8MT33 242 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP6O43182 974 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SULT1B1O43704 296 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 BAIAP3O94812 1187 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 OR5F1O95221 314 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 KCNA3P22001 575 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PHBP35232 272 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 HNF1BP35680 557 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 GALK1P51570 392 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ARFIP2P53365 341 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 KRT71Q3SY84 523 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 MTERF2Q49AM1 385 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 A0A088AWK7 358 aa6.66□□□□□ -1.34
PDE4D-216ENST00000507116 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms