RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	BACH1	O14867	736 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CHRNA1	P02708	482 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PSAP	P07602	524 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	NLRP5	P59047	1200 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	IGBP1	P78318	339 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	KIF2C	Q99661	725 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	GHR	P10912	638 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	XBP1	P17861	261 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	GRB10	Q13322	594 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	LPIN1	Q14693	890 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM167A	Q96KS9	214 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	RIT2	Q99578	217 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	WDR64	B1ANS9	1081 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CCNE2	O96020	404 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SFN	P31947	248 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	NEK4	P51957	841 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SCRN1	Q12765	414 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	STK3	Q13188	491 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PRR16	Q569H4	304 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		13.85	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	RFXAP	O00287	272 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	MAGEB2	O15479	319 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	LPXN	O60711	386 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	PFKFB2	O60825	505 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	LARGE1	O95461	756 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	JAK3	P52333	1124 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	SAMM50	Q9Y512	469 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.84	□□□□□ -0.19
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	RB1	P06400	928 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP3A7	P24462	503 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	KLRC1	P26715	233 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	PAK2	Q13177	524 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464		Q4G0T1	1027 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	WASF1	Q92558	559 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	HLA-C	Q95604	372 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	LENG9	Q96B70	501 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	ENPP3	O14638	875 aa		13.82	□□□□□ -0.2
ABCC3-208	ENST00000506464	MSH4	O15457	936 aa		13.82	□□□□□ -0.2

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