RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 GNRHR2Q96P88 292 aa6.38□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 INCENPQ9NQS7 918 aa6.38□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.38□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.37□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 MUSKO15146 869 aa6.37□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 RRADP55042 308 aa6.37□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.37□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.37□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 AOAHP28039 575 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 MC4RP32245 332 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 RAC3P60763 192 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 CDSNQ15517 529 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 DNAJC7Q99615 494 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 FBXO10Q9UK96 956 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 SCDO00767 359 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 RASGRP1O95267 797 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 C6P13671 934 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 ADCY8P40145 1251 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 HERVK_113P62684 666 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 IL13RA1P78552 427 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 SOGA3Q5TF21 947 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 Q8TCH9 128 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 SCYL1Q96KG9 808 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 GALNT8Q9NY28 637 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 SRRDQ9UH36 339 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 FSHBP01225 129 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 HMGCRP04035 888 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 ETV4P43268 484 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 KCNQ1P51787 676 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 RBL2Q08999 1139 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 BTBD7Q9P203 1132 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 NR2E1Q9Y466 385 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-202ENST00000499038 FOXS1O43638 330 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 MMEP08473 750 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 TACR2P21452 398 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 HIPK4Q8NE63 616 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 BTBD2Q9BX70 525 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 HIP1RO75146 1068 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 ECE1P42892 770 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 RNF151Q2KHN1 245 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 BRAPQ7Z569 592 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 MKL1Q969V6 931 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 WNK4Q96J92 1243 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 VPS11Q9H270 941 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 SLC12A8A0AV02 714 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 FOXP2O15409 715 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 CDC14BO60729 498 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 CR2P20023 1033 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 MEOX1P50221 254 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 STILQ15468 1287 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 ASB15Q8WXK1 588 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 GBP4Q96PP9 640 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 ADOQ96SZ5 270 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 ARHGAP6O43182 974 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-202ENST00000499038 MPIG6BO95866 241 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms