RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497637.5

ACTN4-208, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 877 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-208ENST00000497637 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 MLKLQ8NB16 471 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 RAB34Q9BZG1 259 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 HIPK3Q9H422 1215 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 PP2D1A8MPX8 630 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 IKBKBO14920 756 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 CD4P01730 458 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 POLR2MP0CAP2 368 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 Q4G0T1 1027 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 SARM1Q6SZW1 724 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 HAS1Q92839 578 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 GSDMAQ96QA5 445 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 SLC26A4O43511 780 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 GNASQ5JWF2 1037 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 ISM2Q6H9L7 571 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 DACH1Q9UI36 760 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 ZNF536O15090 1300 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 TBX3O15119 743 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 MYL1P05976 194 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 MYOGP15173 224 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 BMP6P22004 513 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 STAT3P40763 770 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 MTRQ99707 1265 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 MYADML2A6NDP7 307 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 ALADP13716 330 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 ZNF75DP51815 510 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 GJA9P57773 515 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 PLCB2Q00722 1185 aa22.1■■□□□ 1.13
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ACTN4-208ENST00000497637 NCAPHQ15003 741 aa22.1■■□□□ 1.13
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ACTN4-208ENST00000497637 TBC1D5Q92609 795 aa22.1■■□□□ 1.13
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ACTN4-208ENST00000497637 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.1■■□□□ 1.13
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ACTN4-208ENST00000497637 PLCG1P19174 1290 aa22.09■■□□□ 1.13
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ACTN4-208ENST00000497637 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.09■■□□□ 1.13
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ACTN4-208ENST00000497637 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.09■■□□□ 1.13
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ACTN4-208ENST00000497637 HSD17B4P51659 736 aa22.08■■□□□ 1.13
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ACTN4-208ENST00000497637 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTN4-208ENST00000497637 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.08■■□□□ 1.13
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ACTN4-208ENST00000497637 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 SLC43A3Q8NBI5 491 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.07■■□□□ 1.12
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ACTN4-208ENST00000497637 PNMA5Q96PV4 448 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 UIMC1Q96RL1 719 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 TRIM5Q9C035 493 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 RMND1Q9NWS8 449 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTN4-208ENST00000497637 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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