RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 AOAHP28039 575 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 PPP2CBP62714 309 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 PPP2CAP67775 309 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 PHF19Q5T6S3 580 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 HIPK4Q8NE63 616 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 AJUBAQ96IF1 538 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.87□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 KCNK3O14649 394 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 FOXP2O15409 715 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 B4GALT3O60512 393 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 B4GALT4O60513 344 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 ITGB3P05106 788 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 COL6A1P12109 1028 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 POLD1P28340 1107 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 IRF9Q00978 393 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 CPZQ66K79 652 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 CHST13Q8NET6 341 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 APPBP2Q92624 585 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 NUDT11Q96G61 164 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 SAMD11Q96NU1 681 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 BTBD2Q9BX70 525 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 PCIF1Q9H4Z3 704 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 ASB1Q9Y576 335 aa6.86□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 RFPL3O75679 317 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 ASMTLO95671 621 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 SDHAP31040 664 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 MAP3K12Q12852 859 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 SQSTM1Q13501 440 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 ZNF174Q15697 407 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 SLFN13Q68D06 897 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 MBD6Q96DN6 1003 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 LOXL4Q96JB6 756 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 SCYL1Q96KG9 808 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.85□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 ESYT3A0FGR9 886 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 IL18BPO95998 194 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 ADRB1P08588 477 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 EPHB4P54760 987 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 EFEMP1Q12805 493 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 CHST14Q8NCH0 376 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 GBP4Q96PP9 640 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 KATNBL1Q9H079 304 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.84□□□□□ -1.31
RBM39-241ENST00000496183 H7C1D1 291 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 M0R2C6 588 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 HMGCRP04035 888 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 MMEP08473 750 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ECE1P42892 770 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ETV4P43268 484 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ASB15Q8WXK1 588 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 WNK4Q96J92 1243 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ACSS2Q9NR19 701 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 BTBD7Q9P203 1132 aa6.83□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 KRT37O76014 449 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 FNTBP49356 437 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 MEOX1P50221 254 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.321e-7■■■□□ 18.8
RBM39-241ENST00000496183 CFAP100Q494V2 611 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 NME9Q86XW9 330 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 DLG3Q92796 817 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 OR10A5Q9H207 317 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.82□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 MAFGO15525 162 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 CDC45O75419 566 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 CYP17A1P05093 508 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 KCNA6P17658 529 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-241ENST00000496183 CSF2RBP32927 897 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms