RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492338.2

TNS1-218, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 957 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-218ENST00000492338 PRR16Q569H4 304 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 GALNT17Q6IS24 598 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 SLC9A7Q96T83 725 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ZNF577Q9BSK1 485 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 SLC28A3Q9HAS3 691 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PCDHA4Q9UN74 947 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 EMSYQ7Z589 1322 aa11.75□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 RRN3P2A6NIE6 340 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 FAM86B1E9PN63 330 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PFKFB2O60825 505 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 LGR5O75473 907 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PBX2P40425 430 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ABL2P42684 1182 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 USP11P51784 963 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 AK2P54819 239 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 GRIK4Q16099 956 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 TAF2Q6P1X5 1199 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 WASF1Q92558 559 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 GUCD1Q96NT3 240 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 TPCN1Q9ULQ1 816 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa11.74□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 POM121CA8CG34 1229 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 NBNO60934 754 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CXCL10P02778 98 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 FOSL2P15408 326 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 HOXC8P31273 242 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CIITAP33076 1130 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 SLC26A2P50443 739 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 RABGGTBP53611 331 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 IGBP1P78318 339 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 SCRN1Q12765 414 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 BLIDQ8IZY5 108 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 SEPT8Q92599 483 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 GLMNQ92990 594 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 WNT8BQ93098 351 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 VWCEQ96DN2 955 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 UIMC1Q96RL1 719 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 SAMM50Q9Y512 469 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 UNC80Q8N2C7 3258 aa11.73□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 POTEB3A0JP26 581 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PSAPP07602 524 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CTSHP09668 335 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 INSRRP14616 1297 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CLCN6P51797 869 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 KRT76Q01546 638 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PDE4CQ08493 712 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 GRIN2CQ14957 1233 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PDXDC2PQ6P474 469 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 POTEBQ6S5H4 581 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 HERC6Q8IVU3 1022 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 TBCKQ8TEA7 893 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CRYGNQ8WXF5 182 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 MYLIPQ8WY64 445 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ZNF302Q9NR11 478 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 TUBE1Q9UJT0 475 aa11.72□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 MYO9BQ13459 2157 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 M0QZ92 97 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ADAMTS3O15072 1205 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 TLL1O43897 1013 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 HBP1O60381 514 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ATG7O95352 703 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 SEC24BO95487 1268 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 CCNE2O96020 404 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 AMHP03971 560 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 ADAM17P78536 824 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 GPNMBQ14956 572 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 PLCB4Q15147 1175 aa11.71□□□□□ -0.53
TNS1-218ENST00000492338 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.3 ms