RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	29.05	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TET1	Q8NFU7	2136 aa		29.05	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	ACR	P10323	421 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TXK	P42681	527 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	GPNMB	Q14956	572 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	SHH	Q15465	462 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TDH	Q8IZJ6	230 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	IL23A	Q9NPF7	189 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		29.04	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275		A0A1W2PPC1	479 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	STBD1	O95210	358 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	SELP	P16109	830 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	PDC	P20941	246 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	SYT1	P21579	422 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	THPO	P40225	353 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	PRKCE	Q02156	737 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	EPHA7	Q15375	998 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM240	Q5SV17	173 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	BANK1	Q8NDB2	785 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	29.02	■■■□□ 2.24	2e-19	■□□□□ 11.3
TTC3-223	ENST00000492275	COL1A2	P08123	1366 aa		29.01	■■■□□ 2.24
TTC3-223	ENST00000492275	OAT	P04181	439 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	FAM167A	Q96KS9	214 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	OR52Z1	P0C646	297 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	KLRC1	P26715	233 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	RFC2	P35250	354 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	PSMC5	P62195	406 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF365	Q70YC5	407 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	RPAIN	Q86UA6	219 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	RGL1	Q9NZL6	768 aa		29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	MBTPS1	Q14703	1052 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	NBN	O60934	754 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	CAND2	O75155	1236 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	PTGDR	Q13258	359 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	FERMT3	Q86UX7	667 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	DYDC2	Q96IM9	177 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	SI	P14410	1827 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	SLITRK3	O94933	977 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	RSPH10B	P0C881	870 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	TEC	P42680	631 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	XKR3	Q5GH77	459 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	FAM26D	Q5JW98	314 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	MTMR6	Q9Y217	621 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM150B	A6NC51	233 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	POTEM	A6NI47	508 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	C22orf31	O95567	290 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	FGB	P02675	491 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	CTSH	P09668	335 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	BRAP	Q7Z569	592 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TTC3-223	ENST00000492275	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	CHRNA1	P02708	482 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	CXCL10	P02778	98 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	PFKM	P08237	780 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	CYP4A11	Q02928	519 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	ANO5	Q75V66	913 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	CEP89	Q96ST8	783 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	LXN	Q9BS40	222 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TTC3-223	ENST00000492275	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22

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