RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	CDC14B	O60729	498 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	AMY2A	P04746	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	AMY2B	P19961	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	IL13RA1	P78552	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	CSRNP2	Q9H175	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PRODH	O43272	600 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	KLF4	O43474	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	BLACE	A4D250	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PEX11B	O96011	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PTGS1	P23219	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	AOAH	P28039	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	DDR2	Q16832	855 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	RRAD	P55042	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	HERVK_113	P62684	666 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	GPR19	Q15760	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	BTBD2	Q9BX70	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	INCENP	Q9NQS7	918 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	HMGCR	P04035	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	GJA4	P35212	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	PCOLCE	Q15113	449 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TTC3-222	ENST00000491952	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	ARVCF	O00192	962 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	MAK	P20794	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	SEC23A	Q15436	765 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	PRRX2	Q99811	253 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	ADCY3	O60266	1144 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	ADH4	P08319	380 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	MC4R	P32245	332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	MRE11	P49959	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	KCNQ1	P51787	676 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	PAK1	Q13153	545 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TTC3-222	ENST00000491952	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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