RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 RHOT2Q8IXI1 618 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 XXYLT1Q8NBI6 393 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 QARSP47897 775 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 SGO2Q562F6 1265 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 POTEMA6NI47 508 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 MARK3P27448 753 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 CLDN3O15551 220 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ZNF667Q5HYK9 610 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 FAM196BA6NMK8 535 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ENTPD3O75355 529 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 SCARF1Q14162 830 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 NAA35Q5VZE5 725 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 OR6B2Q6IFH4 312 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ECEL1O95672 775 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 KRT1P04264 644 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 EPHB4P54760 987 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 OSTNP61366 133 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 CFAP57Q96MR6 1250 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ZMYND15Q9H091 742 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 DIP2AQ14689 1571 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 CCDC160A6NGH7 325 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ANXA13P27216 316 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18.41■□□□□ 0.54
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NISCH-213ENST00000489895 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ZNF302Q9NR11 478 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 RPS6KA2Q15349 733 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 PRPSAP2O60256 369 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 KCNV1Q6PIU1 500 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 SFR1Q86XK3 245 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ANAPC5Q9UJX4 755 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 MYL3P08590 195 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 AKR1B1P15121 316 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 PSMC5P62195 406 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 DSTYKQ6XUX3 929 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 MGARPQ8TDB4 240 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
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NISCH-213ENST00000489895 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.4■□□□□ 0.54
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NISCH-213ENST00000489895 GDAQ9Y2T3 454 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8IPA6NC78 632 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA8JA6NMD2 632 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 NR3C1P04150 777 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 GNGT1P63211 74 aa18.39■□□□□ 0.54
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NISCH-213ENST00000489895 MTRQ99707 1265 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 CPVLQ9H3G5 476 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 CEP72Q9P209 647 aa18.39■□□□□ 0.54
NISCH-213ENST00000489895 ENC1O14682 589 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 MFAP3LO75121 409 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 INHBAP08476 426 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 CD58P19256 250 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 FCER1AP12319 257 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 KRT10P13645 584 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 BANK1Q8NDB2 785 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 VCXQ9H320 206 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 GPATCH11Q8N954 259 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 LPAR1Q92633 364 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 VCX3BQ9H321 246 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ASB14A6NK59 587 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 LGALS16A8MUM7 142 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 HOXD10P28358 340 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ARL13BQ3SXY8 428 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 ERICH1Q86X53 443 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 KCTD6Q8NC69 237 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 SPON1Q9HCB6 807 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
NISCH-213ENST00000489895 RNF139Q8WU17 664 aa18.38■□□□□ 0.53
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