RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR11Q9BZH6 1224 aa17.08■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPM4Q8TD43 1214 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEPSINQ96N21 525 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP83Q9Y592 693 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BUB1O43683 1085 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYL1P05976 194 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NMT1P30419 496 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VWA3BQ502W6 1294 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MSANTD4Q8NCY6 345 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTYH3Q9C0H2 523 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYO1AQ9UBC5 1043 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VAV3Q9UKW4 847 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 L1RE1Q9UN81 338 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TELO2Q9Y4R8 837 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC53A6NM62 1247 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATP8B1O43520 1251 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCK2O43639 380 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC172P0C7W6 258 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC12A3P55017 1021 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGAP2Q9UHJ9 254 aa17.07■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPM3O75607 178 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP3B2Q13367 1082 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC55Q6ZSA7 311 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGBL3Q8NEM8 1001 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIPK3Q9Y572 518 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POTEB2H3BUK9 544 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COG2Q14746 738 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSP90B2PQ58FF3 399 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTNL9Q6UXG8 535 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNM3Q9UQ16 869 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAMM50Q9Y512 469 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYH10P35580 1976 aa17.06■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP2K7O14733 419 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GAS7O60861 476 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASNSP08243 561 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACTN1P12814 892 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GIT2Q14161 759 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPROQ16827 1216 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP58Q9BVL2 599 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF536O15090 1300 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CASP4P49662 377 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF11P52732 1056 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF577Q9BSK1 485 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEF1Q9HAY2 307 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB21Q9UL25 225 aa17.05■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GCNT3O95395 438 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITGB5P18084 799 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMGCS2P54868 508 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC7A5Q01650 507 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MEA1Q16626 185 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RDH13Q8NBN7 331 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHURC1Q8WUH1 139 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WRNIP1Q96S55 665 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBXN6Q9BZV1 441 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UNC45AQ9H3U1 944 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TISP43B9A030 160 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXD13P35453 343 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCERG1LQ5VWI1 586 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLFN12Q8IYM2 578 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COG1Q8WTW3 980 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATG4CQ96DT6 458 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NT5C3AQ9H0P0 336 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYBL2P10244 700 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP3A7P24462 503 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPS15P42566 896 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EHHADHQ08426 723 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC65Q8IXS2 484 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAAR1Q96RJ0 339 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa17.04■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLITRK3O94933 977 aa17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms