RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 MSH6P52701 1360 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 USP32Q8NFA0 1604 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ATP7BP35670 1465 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ACEP12821 1306 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PQU0 124 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 SH3D21A4FU49 640 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CELA3BP08861 270 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 GRIA2P42262 883 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 LSAMPQ13449 338 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CHRNA2Q15822 529 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 MIB1Q86YT6 1006 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CLDND1Q9NY35 253 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 NTMQ9P121 344 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 MYOM1P52179 1685 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ADGRB2O60241 1585 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 H7BY64 318 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ARNTLO00327 626 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 MAP4K2Q12851 820 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 TESK1Q15569 626 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 USP53Q70EK8 1073 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 GGNQ86UU5 652 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CARFQ8N187 725 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf159Q96HA4 380 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 MST1RQ04912 1400 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PP64 1363 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 KLF4O43474 513 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 IGSF3O75054 1194 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ADRB1P08588 477 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 TEPSINQ96N21 525 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CD163L1Q9NR16 1453 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 DGKIO75912 1065 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 STAT5AP42229 794 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 GJA9P57773 515 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 STEAP3Q658P3 488 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 BRINP3Q76B58 766 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 NME9Q86XW9 330 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-211ENST00000484135 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 RAB33AQ14088 237 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 STK32CQ86UX6 486 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 KYQ8NBH2 561 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 SGSM3Q96HU1 749 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 SYT3Q9BQG1 590 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 FYB1O15117 783 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 PRODHO43272 600 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 DLX3O60479 287 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-211ENST00000484135 THBS2P35442 1172 aa6.32□□□□□ -1.4
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