RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PIK3R5Q8WYR1 880 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP6Q96FZ7 201 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PANK4Q9NVE7 773 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 EVI5O60447 810 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PDHA1P08559 390 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ERVK-9P63128 1117 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF844Q08AG5 666 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NBPF9Q3BBW0 867 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NEK8Q86SG6 692 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL29Q96CT2 875 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TRPC6Q9Y210 931 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CCT8L1PA6NM43 557 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 FLT3P36888 993 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC14Q15048 493 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC38Q502W7 563 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC25Q86WR0 208 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 AGAP11Q8TF27 550 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SWAP70Q9UH65 585 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 UTRNP46939 3433 aa17.67■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CCNE1P24864 410 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ADCY1Q08828 1119 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TTI2Q6NXR4 508 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM24O75264 130 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf89Q6UWU4 347 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PACSIN1Q9BY11 444 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 KCNQ5Q9NR82 932 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PLAGL2Q9UPG8 496 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SH3GL3Q99963 347 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 GDF3Q9NR23 364 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 USP40Q9NVE5 1235 aa17.66■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 RASSF10A6NK89 507 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SART1O43290 800 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 GNA11P29992 359 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 PSMD1Q99460 953 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1B0GUL6 1792 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 RHBDL3P58872 404 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 KCNJ2P63252 427 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL30Q0D2K2 578 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TAF11Q15544 211 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SFMBT2Q5VUG0 894 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SPICE1Q8N0Z3 855 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 DBNDD1Q9H9R9 158 aa17.65■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TRAF5O00463 557 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 SLC37A4O43826 429 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 CHN1P15882 459 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 ATP2B4P23634 1241 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 VWA3BQ502W6 1294 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf86Q6ZW13 317 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 FAM133AQ8N9E0 248 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 NEDD1Q8NHV4 660 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 HOOK2Q96ED9 719 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 C15orf41Q9Y2V0 281 aa17.64■□□□□ 0.42
CCSAP-204ENST00000483092 IRS2Q9Y4H2 1338 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 IKQ13123 557 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CALCRLQ16602 461 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 OTUD6AQ7L8S5 288 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0825Q8IV33 1275 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD42Q8N9B4 389 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CALML4Q96GE6 196 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT12Q9BQG2 462 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 COPB2P35606 906 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 PPP4CP60510 307 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 LLGL1Q15334 1064 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 KRT25Q7Z3Z0 450 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 KCNK9Q9NPC2 374 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SH3GLB2Q9NR46 395 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TSKSQ9UJT2 592 aa17.64■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 A8MUI8 341 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC34Q8IZ02 419 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 GLIS3Q8NEA6 775 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 TTI1O43156 1089 aa17.63■□□□□ 0.41
CCSAP-204ENST00000483092 KLRC4O43908 158 aa17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms