RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481410.1

C7orf49-208, human

TSL 2

Gene C7orf49, Length 976 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C7orf49-208	ENST00000481410	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	ITGB1	P05556	798 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	IFNAR1	P17181	557 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	GHRHR	Q02643	423 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	PLVAP	Q9BX97	442 aa		14.72	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	AR	P10275	920 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	TRAF1	Q13077	416 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	ZBTB33	Q86T24	672 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	P2RX5	Q93086	422 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	PIGS	Q96S52	555 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	AMN	Q9BXJ7	453 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		14.71	□□□□□ -0.05
C7orf49-208	ENST00000481410	ABCB11	O95342	1321 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	LARGE1	O95461	756 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	BRD1	O95696	1058 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	MCM2	P49736	904 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	SCRN1	Q12765	414 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	ME3	Q16798	604 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	RGS22	Q8NE09	1264 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	GTF3C6	Q969F1	213 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	MYH6	P13533	1939 aa		14.7	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	ATRX	P46100	2492 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410		B4DLN1	442 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	CTSH	P09668	335 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	ST3GAL1	Q11201	340 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	PPTC7	Q8NI37	304 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	APBB2	Q92870	758 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	S1PR5	Q9H228	398 aa		14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	STK36	Q9NRP7	1315 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	PER2	O15055	1255 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	TREH	O43280	583 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	HOXC8	P31273	242 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	CLCN5	P51795	746 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	POF1B	Q8WVV4	589 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	TTC3	P53804	2025 aa		14.68	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	ENPP3	O14638	875 aa		14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	OPLAH	O14841	1288 aa		14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	DGKI	O75912	1065 aa		14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	CDKL5	O76039	1030 aa		14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	MTMR3	Q13615	1198 aa		14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	LAMC2	Q13753	1193 aa		14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
C7orf49-208	ENST00000481410	HOMER1	Q86YM7	354 aa		14.67	□□□□□ -0.06

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