RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	CAND2	O75155	1236 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	OAT	P04181	439 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	CYP2C18	P33260	490 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	BMP8B	P34820	402 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	PRPH	P41219	470 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	TXK	P42681	527 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	PSMC5	P62195	406 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	PTGDR	Q13258	359 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	RPAIN	Q86UA6	219 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	BANK1	Q8NDB2	785 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	POTEM	A6NI47	508 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	STBD1	O95210	358 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	LYPLA2	O95372	231 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	C22orf31	O95567	290 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	BMP15	O95972	392 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	CKB	P12277	381 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	FPGS	Q05932	587 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7	2e-6	■□□□□ 8.5
SFI1-222	ENST00000478887	BECN1	Q14457	450 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	XKR3	Q5GH77	459 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	C4orf19	Q8IY42	314 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM199	Q8N511	208 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	LXN	Q9BS40	222 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SFI1-222	ENST00000478887	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	IQCF3	P0C7M6	154 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CSF2RA	P15509	400 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SELP	P16109	830 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RFC2	P35250	354 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CCL23	P55773	120 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	IGBP1	P78318	339 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	VWCE	Q96DN2	955 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SCLY	Q96I15	445 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	DYDC2	Q96IM9	177 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CEP89	Q96ST8	783 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RGL1	Q9NZL6	768 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887		A0A1W2PPC1	479 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SLITRK3	O94933	977 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PFKM	P08237	780 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	THPO	P40225	353 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TEC	P42680	631 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	EPHB4	P54760	987 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	CYP4A11	Q02928	519 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	FAM26D	Q5JW98	314 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ANO5	Q75V66	913 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	RAB34	Q9BZG1	259 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	IL23A	Q9NPF7	189 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	PPME1	Q9Y570	386 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM150B	A6NC51	233 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MAGEB2	O15479	319 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	MED24	O75448	989 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SFI1-222	ENST00000478887	F13A1	P00488	732 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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