RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 ATP4AP20648 1035 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 RGS2P41220 211 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 NEDD9Q14511 834 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 TTLL4Q14679 1199 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SCFD2Q8WU76 684 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 SPATA33Q96N06 139 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 MAP7D2Q96T17 732 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-217ENST00000475693 EYA4O95677 639 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 HOXC6P09630 235 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF165P49910 485 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 METTL7BQ6UX53 244 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ANO10Q9NW15 660 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SFNP31947 248 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PSMC5P62195 406 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 RINT1Q6NUQ1 792 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ANO5Q75V66 913 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 GSDMAQ96QA5 445 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 NACC1Q96RE7 527 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 MGAMO43451 1857 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PSAPP07602 524 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 MARK3P27448 753 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 STK4Q13043 487 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 UVSSAQ2YD98 709 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 TRIB2Q92519 343 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 GPR20Q99678 358 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 VTA1Q9NP79 307 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 STBD1O95210 358 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ELNP15502 786 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SOX10P56693 466 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 AMPD3Q01432 767 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGAP1Q07960 439 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 MED15Q96RN5 788 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 APBA2Q99767 749 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 REEP2Q9BRK0 252 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 GPR25O00155 361 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ATG7O95352 703 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 STX17P56962 302 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 GIT2Q14161 759 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 LRRC41Q15345 812 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 AOPEPQ8N6M6 819 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 TRPV1Q8NER1 839 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 AFG1LQ8WV93 481 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF302Q9NR11 478 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 STK24Q9Y6E0 443 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 WDR81Q562E7 1941 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 RARRES1P49788 294 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PRKCEQ02156 737 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 IQCB1Q15051 598 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 C4orf19Q8IY42 314 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.11■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 XKR9Q5GH70 373 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PADI6Q6TGC4 694 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PANK4Q9NVE7 773 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PRCPP42785 496 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 NEK9Q8TD19 979 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 EXOC1Q9NV70 894 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms