RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 C16orf92Q96LL3 132 aa6.59□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 SGPP1Q9BX95 441 aa6.59□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.59□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.59□□□□□ -1.35
PRPF40A-208ENST00000472760 GOLGA6L22H0YM25 854 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SEMA7AO75326 666 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 C8BP07358 591 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ATF2P15336 505 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 PTGS1P23219 599 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 AOAHP28039 575 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 PFKPQ01813 784 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNN1Q92952 543 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 VTA1Q9NP79 307 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.58□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 N4BP3O15049 544 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM253P0C7T8 217 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 TTC38Q5R3I4 469 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 C7orf31Q8N865 590 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 MENTQ9BUN1 341 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 BTBD7Q9P203 1132 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 MSRAQ9UJ68 235 aa6.57□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF839A8K0R7 811 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 KDM1AO60341 852 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 MC4RP32245 332 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 EPHB3P54753 998 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ODR4Q5SWX8 454 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 LIPIQ6XZB0 460 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 PROSER1Q86XN7 944 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 WDR48Q8TAF3 677 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 CALML6Q8TD86 181 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 TMEM209Q96SK2 561 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 INCENPQ9NQS7 918 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 DLL4Q9NR61 685 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 LCHNA4D1U4 455 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 K7ESF4 209 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SCAND1P57086 179 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 DLG4P78352 724 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 FOXO4P98177 505 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ROM1Q03395 351 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 STK32CQ86UX6 486 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 MAML3Q96JK9 1138 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SYT3Q9BQG1 590 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 GCM1Q9NP62 436 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 GALNT8Q9NY28 637 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 NFIBO00712 420 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ALDH1L1O75891 902 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 APOL3O95236 402 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 GLRBP48167 497 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ERVK-21P61565 698 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SLC6A3Q01959 620 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 MCTP1Q6DN14 999 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 DTX3Q8N9I9 347 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 CLIC6Q96NY7 704 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 FOXB1Q99853 325 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 POFUT1Q9H488 388 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 WASF3Q9UPY6 502 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.54□□□□□ -1.36
PRPF40A-208ENST00000472760 GABRDO14764 452 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms