RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-208ENST00000468570 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 TRIM48Q8IWZ4 208 aa3.49□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 BACH2Q9BYV9 841 aa3.49□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 FAM184BQ9ULE4 1060 aa3.49□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa3.49□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 BLACEA4D250 179 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 LMNAP02545 664 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 GCP02774 474 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 GRK2P25098 689 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 GRK3P35626 688 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 RGS19P49795 217 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 MRE11P49959 708 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 NFYCQ13952 458 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 USP30Q70CQ3 517 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 USP53Q70EK8 1073 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 MRGPREQ86SM8 312 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 SHCBP1Q8NEM2 672 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 CPLX3Q8WVH0 158 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 ANAPC16Q96DE5 110 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 PHF20Q9BVI0 1012 aa3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 TMEM191CA6NGB0 347 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 KCNK3O14649 394 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 ITGAEP38570 1179 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 CASP7P55210 303 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 HHEXQ03014 270 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 EPHA10Q5JZY3 1008 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 LRSAM1Q6UWE0 723 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 KCTD1Q719H9 257 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 OTOP2Q7RTS6 562 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 SH3RF2Q8TEC5 729 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 DSEQ9UL01 958 aa3.47□□□□□ -1.85
SGIP1-208ENST00000468570 FAM90A27PA6NNH2 459 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 SUSD5O60279 629 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 CUTAO60888 179 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 CPP00450 1065 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 CD83Q01151 205 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 RIN1Q13671 783 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 TESK1Q15569 626 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 CYP4F22Q6NT55 531 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 RTKN2Q8IZC4 609 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 OR6P1Q8NGX9 317 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 GPRASP2Q96D09 838 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 RIC8BQ9NVN3 520 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa3.46□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 KIAA0355O15063 1070 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 NAT2P11245 290 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 NR4A1P22736 598 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 PTH2RP49190 550 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 PTTG1IPP53801 180 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 HGFACQ04756 655 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 ADAM15Q13444 863 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 BTBD8Q5XKL5 378 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 SCYL1Q96KG9 808 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 IER2Q9BTL4 223 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 MRVI1Q9Y6F6 885 aa3.45□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 GRID2IPA4D2P6 1211 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 PEX11BO96011 259 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 CLK3P49761 638 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 CCDC27Q2M243 656 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 TMCO4Q5TGY1 634 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 LRP10Q7Z4F1 713 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 MB21D1Q8N884 522 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 IPPKQ9H8X2 491 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 A0A1W2PRX2 142 aa3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 ZAR1LA6NP61 321 aa3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 SLC26A4O43511 780 aa3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 DLX3O60479 287 aa3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 MEOX1P50221 254 aa3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 PPP2R2AP63151 447 aa3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 RBM10P98175 930 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 NCAPHQ15003 741 aa3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
SGIP1-208ENST00000468570 SYCE2Q6PIF2 218 aa3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms