RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 CAND2O75155 1236 aa24.11■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 ATP4AP20648 1035 aa24.11■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 TRAPPC10P48553 1259 aa24.11■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF484Q5JVG2 852 aa24.11■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 B3GNT9Q6UX72 402 aa24.11■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 SNX21Q969T3 373 aa24.11■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.11■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 WNT7AO00755 349 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 RSPH10BP0C881 870 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF174Q15697 407 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 TTC38Q5R3I4 469 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 MARCH8Q5T0T0 291 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 HSCBQ8IWL3 235 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 VAV3Q9UKW4 847 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 SCN5AQ14524 2016 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 WDR81Q562E7 1941 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa24.1■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 COL1A2P08123 1366 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 ACTN1P12814 892 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 PDCP20941 246 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 TXKP42681 527 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 RUFY4Q6ZNE9 571 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.09■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 EML1O00423 815 aa24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 OATP04181 439 aa24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 CTSHP09668 335 aa24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 KLRC1P26715 233 aa24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 PRKCEQ02156 737 aa24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 OTOP2Q7RTS6 562 aa24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa24.08■■□□□ 1.45
ABCD4-202ENST00000460308 TANC1Q9C0D5 1861 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF862O60290 1169 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 PSMC5P62195 406 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 EPHA7Q15375 998 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 UGCGQ16739 394 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 RPAINQ86UA6 219 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 BANK1Q8NDB2 785 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 HERVK_113Q902F9 699 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 ZBTB10Q96DT7 871 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 MTMR9Q96QG7 549 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.07■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 ZBBXA8MT70 800 aa24.06■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 P4HBP07237 508 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 QARSP47897 775 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.06■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.06■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 M0QZ92 97 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 NBNO60934 754 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 OR52Z1P0C646 297 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 XKR3Q5GH77 459 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 IER5Q5VY09 327 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 MAGEB2O15479 319 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 CXCL10P02778 98 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 GPNMBQ14956 572 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 FAM26DQ5JW98 314 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 NME8Q8N427 588 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 METTL13Q8N6R0 699 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 VWCEQ96DN2 955 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 EVPLQ92817 2033 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 TET1Q8NFU7 2136 aa24.04■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 ZBTB42B2RXF5 422 aa24.03■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.03■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 NBR1Q14596 966 aa24.03■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 CNKSR3Q6P9H4 555 aa24.03■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.03■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 TMOD1P28289 359 aa24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 TECP42680 631 aa24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 MBTPS1Q14703 1052 aa24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 MTERF2Q49AM1 385 aa24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 RASIP1Q5U651 963 aa24.02■■□□□ 1.44
ABCD4-202ENST00000460308 TPH2Q8IWU9 490 aa24.02■■□□□ 1.44
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