RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PANK4Q9NVE7 773 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CAND2O75155 1236 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SHBGP04278 402 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CLTAP09496 248 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 C12orf60Q5U649 245 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 MSL1Q68DK7 614 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 LRIG3Q6UXM1 1119 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SPAG5Q96R06 1193 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CD209Q9NNX6 404 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.84■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 E9PMD0 336 aa16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 CDC25CP30307 473 aa16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 BTDP43251 543 aa16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 TNNI2P48788 182 aa16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 NAA25Q14CX7 972 aa16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 GJB7Q6PEY0 223 aa16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 SCFD2Q8WU76 684 aa16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 MIEF2Q96C03 454 aa16.83■□□□□ 0.29
SFRP4-201ENST00000436072 BAG3O95817 575 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PDE6BP35913 854 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PLCB4Q15147 1175 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MFSD14BQ5SR56 506 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 KRT79Q5XKE5 535 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PEX26Q7Z412 305 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TATDN2Q93075 761 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 POLLQ9UGP5 575 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GGA1Q9UJY5 639 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 NEBLO76041 1014 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 DAAM2Q86T65 1068 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 RPAINQ86UA6 219 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MTFR1LQ9H019 292 aa16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 NHSQ6T4R5 1651 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 DRD4P21917 467 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 IFNAR2P48551 515 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 USP11P51784 963 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 EIF6P56537 245 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ADAM9Q13443 819 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CUL1Q13616 776 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 UBE2SQ16763 222 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 WLSQ5T9L3 541 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GNA11P29992 359 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 KCNH2Q12809 1159 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM266Q2M3C6 531 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PSMD1Q99460 953 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.82■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SLCO1A2P46721 670 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 BIRC3Q13489 604 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PICALMQ13492 652 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 PPP2R5AQ15172 486 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GALNT17Q6IS24 598 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CCT6BQ92526 530 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 RGL2O15211 777 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 CHN1P15882 459 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SEMA3FQ13275 785 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 DRP2Q13474 957 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 SBK1Q52WX2 424 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 TEX11Q8IYF3 940 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GLG1Q92896 1179 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MTMR9Q96QG7 549 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 MXD3Q9BW11 206 aa16.81■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 USP17L5A8MUK1 530 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 F8VZ95 297 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 FGGP02679 453 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 GTF2IP78347 998 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 DNAJC19Q96DA6 116 aa16.8■□□□□ 0.28
SFRP4-201ENST00000436072 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms