RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 LENG9Q96B70 501 aa21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 KRT12Q99456 494 aa21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM31Q9BZY9 425 aa21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.56■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SBF2Q86WG5 1849 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GBP3Q9H0R5 595 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 FAM53CQ9NYF3 392 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 CEP104O60308 925 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 RPA1P27694 616 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GUCY2DQ02846 1103 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 C8orf74Q6P047 294 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 HOOK2Q96ED9 719 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 IDI2Q9BXS1 227 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TSGA10Q9BZW7 698 aa21.55■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 NFIBO00712 420 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 HOXD13P35453 343 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GGCXP38435 758 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 HGSNATQ68CP4 663 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 RINT1Q6NUQ1 792 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 CREG2Q8IUH2 290 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SELENOOQ9BVL4 669 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 EHD4Q9H223 541 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 KIF20AO95235 890 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 LDHDQ86WU2 507 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 CEP72Q9P209 647 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 USP20Q9Y2K6 914 aa21.54■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 EXOC3O60645 756 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 WDR11Q9BZH6 1224 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 RNF40O75150 1001 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 EGFRP00533 1210 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SERPING1P05155 500 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 UCHL3P15374 230 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 INPP5BP32019 993 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 NT5C2P49902 561 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 AP3B2Q13367 1082 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 IL31RAQ8NI17 732 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TAF4BQ92750 862 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TLR10Q9BXR5 811 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.53■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SLITRK3O94933 977 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SREBF1P36956 1147 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SOX10P56693 466 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 MKL1Q969V6 931 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 A0A1W2PQJ5 194 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 SPDYE6P0CI01 402 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 GOPCQ9HD26 462 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 NFU1Q9UMS0 254 aa21.52■■□□□ 1.04
TTLL3-210ENST00000427220 ZBTB7AO95365 584 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 COPB2P35606 906 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.031e-6■■■■■ 58.2
TTLL3-210ENST00000427220 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 LXNQ9BS40 222 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 RAB21Q9UL25 225 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 DPEP1P16444 411 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 CYP2C19P33261 490 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa21.51■■□□□ 1.03
TTLL3-210ENST00000427220 ACP6Q9NPH0 428 aa21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms