RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 PTPN18Q99952 460 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 POLLQ9UGP5 575 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.91□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 HPXP02790 462 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 MX1P20591 662 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 MAP3K11Q16584 847 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 CASC1Q6TDU7 716 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 TTC6Q86TZ1 520 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 SUCLG2Q96I99 432 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 CLMNQ96JQ2 1002 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 GUCD1Q96NT3 240 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 GDF15Q99988 308 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 SP110Q9HB58 689 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.9□□□□□ -1.14
CCL20-202ENST00000409189 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 PIEZO1Q92508 2521 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 B8ZZF3 427 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 BBOX1O75936 387 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 PDE1AP54750 535 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 TCIRG1Q13488 830 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 LILRA6Q6PI73 481 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 PHC3Q8NDX5 983 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 ABHD4Q8TB40 342 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 GPATCH3Q96I76 525 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 WNK4Q96J92 1243 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 GMLQ99445 158 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 CDH23Q9H251 3354 aa7.89□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 NCOR1O75376 2440 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 RPTORQ8N122 1335 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 PSME4Q14997 1843 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 WASH4PA8MWX3 477 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 C1QTNF9P0C862 333 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 MED14OSP0DP75 135 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 RAC2P15153 192 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 CASP7P55210 303 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 DAB2P98082 770 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 GRAPQ13588 217 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 KAZALD1Q96I82 304 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 HTATIP2Q9BUP3 242 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 COPRSQ9NQ92 184 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 SSC5DA1L4H1 1573 aa7.88□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 FAM221AA4D161 298 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 CILPO75339 1184 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 CTSHP09668 335 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 INHBEP58166 350 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 ERVFC1P60507 584 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 GPSM2P81274 684 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 BECN1Q14457 450 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 LRIT3Q3SXY7 679 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 FAM122AQ96E09 287 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 DIRC2Q96SL1 478 aa7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CCL20-202ENST00000409189 CD320Q9NPF0 282 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms