RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 PADI6Q6TGC4 694 aa18.6■□□□□ 0.57
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SH3BP4-202ENST00000392011 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.6■□□□□ 0.57
SH3BP4-202ENST00000392011 MSTO1Q9BUK6 570 aa18.6■□□□□ 0.57
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SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC197Q8NCU1 140 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 NEK9Q8TD19 979 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 AP5M1Q9H0R1 490 aa18.57■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 EXOC8Q8IYI6 725 aa18.57■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 ANTXR2P58335 489 aa18.56■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 PIM2Q9P1W9 311 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR64B1ANS9 1081 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 RWDD2BP57060 319 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 WHAMMQ8TF30 809 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 WRNIP1Q96S55 665 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 BEGAINQ9BUH8 593 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 PDIA6Q15084 440 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 KCTD6Q8NC69 237 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
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