RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R16BQ96T49 567 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLVAPQ9BX97 442 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 AMNQ9BXJ7 453 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 CWH43Q9H720 699 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 TLE6Q9H808 572 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 PADI3Q9ULW8 664 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZZEF1O43149 2961 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLRF2D3W0D1 207 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 FGF18O76093 207 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCG2P13521 617 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNA2P16389 499 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPR3P17342 541 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TECP42680 631 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ID4P47928 161 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDE1AP54750 535 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 DGKHQ86XP1 1220 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 KAT14Q9H8E8 782 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 AAASQ9NRG9 546 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 MEIS2O14770 477 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB5O15062 677 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLR2MP0CAP2 368 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 INSRRP14616 1297 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITGB5P18084 799 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB33Q86T24 672 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCLK2Q8N568 766 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ESR2Q92731 530 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 EVI5LQ96CN4 794 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEK1Q96PY6 1258 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRRX2Q99811 253 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP26Q9BXU7 913 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 PNMA2Q9UL42 364 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 R4GN57 208 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPEGQ15772 3267 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRIP11Q15643 1979 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 NRCAMQ92823 1304 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARID2Q68CP9 1835 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 VWA8A3KMH1 1905 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 C9IYK1 514 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 FIBPO43427 364 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 B4GALT3O60512 393 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TGFB3P10600 412 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 MS4A1P11836 297 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDE4AP27815 886 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXK2Q01167 660 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRM4Q14833 912 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLCB4Q15147 1175 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 PKN1Q16512 942 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBE2SQ16763 222 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA2013Q8IYS2 634 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 FLCNQ8NFG4 579 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCF25Q9BQ70 676 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYL10Q9BUA6 226 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-171P-201ENST00000384354 RIOX1Q9H6W3 641 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms